九江市交通运输局是主管全市公路和水路交通行业的市人民政府工作部门。内设办公室、运输管理科、计划统计科、财务审计科、人事教育科、安全监督科、政策法规科、行政许可科、信息科9个职能科室和九江市交通战备办公室、机关党委两个机构。直属事业单位5个：市公路管理所（市渡口管理所）、市交通工程质量质监所、九江民航管理局、九江市道路运输管理局、九江市港航管理局；直属企业单位4个：九江长运集团公司、九江公共交通集团公司、九江市装卸运输公司和九江市航运总公司。全市15个县（市、区、山）设交通运输局（浔阳区除外），归所在县（市、区、山）人民政府领导，业务上接受市交通运输局指导。 

　　机构职责：

　　1、贯彻执行国家关于交通运输的法律法规和政策，拟订全市公路和水路等行业规划、规定、标准并组织实施。指导公路、水路行业有关体制改革工作。

　　2、承担公路、水路运输体系的规划协调工作，在全市经济社会发展总体规划的框架内，组织编制公路、水路运输体系规划，指导公路、水路运输枢纽管理，协调民航相关工作。

　　3、承担道路、水路运输市场监管责任。指导城乡客运及有关设施规划和管理工作，指导出租车行业管理工作。负责汽车运输、船舶运输有关管理工作。

　　4、指导做好道路运输、水路运输安全监管工作。负责港口设施安保及危险品运输监督管理工作。

　　5、承担公路、水路建设市场监管责任。执行公路、水路工程建设相关政策、制度和技术标准并监督实施，组织协调公路、水路有关重点工程建设和工程质量、安全生产监督管理工作，指导交通运输基础设施管理和维护。按规定负责港口规划和岸线使用管理工作。

　　6、指导公路、水路行业安全生产和应急管理工作。按规定组织协调重点物资运输和紧急客货运输。承担国防动员有关工作。

　　7、指导交通运输信息化建设，监测分析运行情况，开展相关统计工作，发布有关信息。指导公路、水路行业环境保护和节能减排工作。

　　8、承办市人民政府交办的其他事项。